大宋年间，龙牙县旱情四起，当地百姓认为是锁龙井当中的龙王发怒，需将童男童女投入锁龙井祭祀蛟龙方能得享安宁。祭祀恶俗持续多时，每逢天灾就行祭祀之举，不知多少无辜孩童葬身井底。新科进士庄严刚任龙牙县主薄，闻听此事坚持将童男童女救下，却不想竟意外卷进一宗离奇杀人案而锒铛入狱；龙牙县仵作助手小宛为救心上人，不远千里求请已到暮年的宋慈（欧阳震华饰）出山查明真相。然而前来查案的宋慈却发现，真相并没有他想象中那么简单。